1959年5月，锡林郭勒盟档案馆成立，同年9月，锡林郭勒盟行政公署设立锡林郭勒盟档案处，档案馆归属档案处，一套人马，两个牌子，统一管理全盟党政档案工作。1962年6月，锡盟档案处撤销，中共锡盟委办公室下设档案科，档案馆与档案科一套人马，两个牌子。1963年4月，锡盟档案处恢复，1965年11月，锡盟档案处撤销。

　　“文化大革命”初期的1967年至1972年，锡盟档案馆处于瘫痪状态。1973年8月，锡盟档案馆恢复，归属锡盟革命委员会办公室，1973年12月，锡盟革命委员会设立档案局。1979年3月，锡盟档案局充实加强，受中共锡盟委、锡盟行署双重领导。档案局内设文书档案指导科、技术档案指导科、秘书科、档案馆。1983年，全盟进行机构改革，锡盟档案局撤销，业务归档案馆，1985年4月恢复档案局，并改称档案处，归锡盟行署领导，内设办公室、整理保管科、业务指导科、编研科。1986年6月，整理保管科改称档案馆,与处内科室平行。1990年锡盟档案处调整内设科室,设办公室、人事教育科、业务指导一科、业务指导二科、档案馆。1995年5月，锡盟档案处更命为锡盟档案局，由中共锡盟委办公室领导，局下设办公室、人事教育科、档案馆室业务监督指导科、经济档案业务监督指导科、档案馆。1995年12月，档案馆更名为档案管理科，局馆合一。